مهم‌ترین تغییرات این دستورالعمل عبارتند از:
تغییر در طبقه‌بندی صندوق‌ها: عناوین «خرد، کوچک، متوسط و بزرگ» به «نوع اول، نوع دوم، نوع سوم و بزرگ» تغییر یافت.
امکان استفاده از درگاه پرداخت اینترنتی: ممنوعیت استفاده درگاه پرداخت اینترنتی برای صندوق های نوع اول و دوم و سوم برداشته شد و این صندوق‌ها در چارچوب ضوابط و مقرات ابلاغی بانک مرکزی مجاز به استفاده از درگاه پرداخت اینترنتی هستند.
رفع محدودیت سپرده‌گذاری در مؤسسات اعتباری: محدودیت در تعداد مؤسسات اعتباری که صندوق‌های قرض الحسنه موظف بودند منابع نقد خود را صرفا نزد آنها سپرده‌گذاری کنند، برداشته شد.
افزایش میزان منابع نقدی سپرده‌گذاری در مؤسسات اعتباری: میزان منابع نقدی که صندوق‌های نوع اول و دوم (صندوق‌های خرد و کوچک سابق) می‌بایست نزد مؤسسات اعتباری در قالب سپرده سرمایه‌گذاری مدت‌دار نگهداری کنند، از ده درصد به حداکثر بیست درصد افزایش یافت.
امکان افزایش سرمایه از محل مازاد تجدید ارزیابی دارایی‌های ثابت: امکان افزایش سرمایه از محل مازاد تجدید ارزیابی دارایی‌های ثابت حداکثر به میزان حداکثر سی درصد سرمایه ثبتی مهیا شد.
تغییر سقف تسهیلات: سقف تسهیلات قابل پرداخت به هر شخص در صندوق‌های نوع اول، دوم و سوم ۱.۵ میلیارد ریال تعیین شد. پرداخت تا ۲۰۰ میلیون ریال توسط صندوق و تا سقف ۱.۵ میلیارد منوط به تصویب هیئت مدیره و تأیید عامل نظارتی است.
ثبات در سایر حدود: حداقل ذخیره نقدی ۵ درصد، حداکثر مدت بازپرداخت ۳۶ ماه برای صندوق‌های نوع اول تا سوم و ۶۰ ماه برای صندوق بزرگ، و حداکثر ۵۰ شعبه برای صندوق بزرگ بدون تغییر باقی مانده است.
این دستورالعمل از زمان ابلاغ، مبنای عمل صندوق‌های قرض‌الحسنه و نهادهای نظارتی خواهد بود.